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通風柜的功能主要的是隔離和排氣。在化學實驗中，經常會產生各種有害氣體、臭氣、濕氣以及易燃、易爆、腐蝕性物質，為了保護使用者的安全，防止實驗中的污染物質向實驗室擴散，把構成污染源的實驗放進通風柜中去做是最好的辦法。
以往通風柜使用臺數較少，只在特別有害且危險的氣體及產生大量熱的實驗中使用。通風柜只擔負實驗臺的輔助功能。近年來考慮到改善實驗環境，很多原來在實驗臺上進行的實驗逐漸轉移到通風柜內。這就要求在通風柜要具有相應的使用功能。特別是大多數新建的實驗室都有空調，因此在建筑的初步設計階段就要將通風柜的使用臺數納入空調系統的計劃。由于通風柜在生化實驗室中占有非常重要的位置，從改善實驗室環境、改善勞動衛生條件，提高工作效率等方面考慮，通風柜的使用臺數將會大幅地增加。
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